Det var sandsynligvis arabiske købmænd, der første gang opdagede Bentota i løbet af 1100-tallet. Mange år senere, da portugiserne styrede landet i 1700-tallet, byggede de et fort ved flodmundingen ved Bentota. Dette fort blev under hollændernes regeringsperiode omdannet til hvilested for transport mellem Colombo og Galle. I 1970'erne blev fortet omdannet til hotel.
I dag er Bentota et yndet mål for besøgende, der ønsker lækkert vand og strand. Stranden ved Bentota er dog så lang og bred, at der sjældent virker fyldt her. Man kan derfor uforstyrret nyde det rolige vand under en palme.